研究报告

陆地棉LACS基因家族生物信息学分析  

刘文豪 , 田琴 , 王旭文 , 余渝 , 司爱君 , 赵福相 , 孔宪辉*
新疆农垦科学院棉花研究所, 农业部西北内陆区棉花生物学与遗传育种重点实验室, 石河子, 832000
作者    通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2021 年, 第 19 卷, 第 6 篇   
收稿日期: 2020年05月18日    接受日期: 2020年05月21日    发表日期: 2021年07月25日
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摘要

长链酰基辅酶 A 合成酶(LACS)是脂肪代谢网络中的关键酶,催化长链酰基辅酶 A 的合成并在多种生物过程中发挥作用。本研究以拟南芥中长链酰基辅酶 A 合成酶家族的基因序列为参考来探究 LACS 在陆地棉基因组中的数量和分布情况。通过生物信息学方法综合分析陆地棉 GhLACS 基因家族,发现该家族含有 21 个成员,CDS 序列长度为 1 938~2 274 bp,编码氨基酸数量为 645~757 个,定位在 15 条染色体上。SOPMA 预测蛋白二级结构,发现该家族成员的蛋白二级结构均以 - 螺旋、- 转角、延伸链、无规则卷曲组成。亚细胞定位分析发现 7 个基因定位在过氧化物酶体,6 个基因定位在叶绿体,8 个基因定位在内质网。基因结构分析表明同一亚组内含子和外显子的排列分布较为相似,而不同亚组间存在一定的差异性。本研究有助于了解陆地棉 GhLACS 家族的功能,并且为棉籽油脂质代谢提供理论依据。
 

关键词
陆地棉;长链酰基辅酶 A 合成酶;生物信息学

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《分子植物育种》印刷版
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